吉林大學(xué)第二醫(yī)院眼科中心始創(chuàng)于1936年，其淵源可追溯至偽滿新京特別市立醫(yī)院眼科，后隨學(xué)校幾易其名，歷經(jīng)中國人民解放軍第一軍醫(yī)大學(xué)附屬二院眼科、吉林醫(yī)科大學(xué)附屬二院眼科、白求恩醫(yī)科大學(xué)第二臨床學(xué)院眼科等發(fā)展階段，經(jīng)過張文山、董世范、朱文榮、黃秀貞、張美玉、劉克非、王維興、張曉光、吳雅臻等幾代人的奮斗，為科室的發(fā)展壯大奠定了堅實(shí)的基礎(chǔ)，也樹立了良好的學(xué)術(shù)氛圍。2004年11月在原有眼科基礎(chǔ)上成立了眼科醫(yī)院，現(xiàn)已成為集醫(yī)療、教學(xué)、科研、預(yù)防及保健為一體的區(qū)域領(lǐng)先、國內(nèi)先進(jìn)的現(xiàn)代化大型眼科中心。1998年成為吉林省首個眼科學(xué)博士學(xué)位授權(quán)點(diǎn)，目前是吉林省重點(diǎn)學(xué)科、吉林省臨床重點(diǎn)專科、吉林大學(xué)重點(diǎn)學(xué)科，為吉林省眼科繼續(xù)醫(yī)學(xué)教育基地、吉林省眼科重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、吉林省眼科質(zhì)量控制中心、吉林省眼病防治中心、吉林大學(xué)眼科中心所在地。
全院現(xiàn)有各類專業(yè)人員180余人，其中教授（主任醫(yī)師）14人，副教授（副主任醫(yī)師）19人，博士生導(dǎo)師4人、碩士生導(dǎo)師24人。醫(yī)療系列66人中有46人獲得博士學(xué)位，8人在讀博士，共占82%;副高職以上人員均先后在北京、上海、廣州等國內(nèi)知名眼科中心進(jìn)行技術(shù)交流或研修，并經(jīng)常派出參加國際學(xué)術(shù)會議，中青年骨干多數(shù)具有美國、英國、日本、德國、瑞典、瑞士、新加坡、香港等國家和地區(qū)留學(xué)和交流經(jīng)歷，這其中不乏哈佛大學(xué)、牛津大學(xué)、東京大學(xué)、京都大學(xué)、秋田大學(xué)、卡羅林斯卡醫(yī)學(xué)院等國際名校，多人在國外獲博士學(xué)位后回國工作，為眼科臨床和科研工作不斷注入新鮮血液，優(yōu)秀的學(xué)術(shù)梯隊已經(jīng)成為學(xué)科持續(xù)發(fā)展和進(jìn)步的源泉。
眼科中心成立以來，獲國家自然科學(xué)基金資助12項(xiàng)，參與國家“211”工程建設(shè)項(xiàng)目子課題1項(xiàng)，取得數(shù)十項(xiàng)省部級科研基金資助并獲得獎勵，共發(fā)表核心期刊論文400余篇，其中40余篇被SCI檢索收錄，3篇論文摘要被美國眼科與視覺科學(xué)年會（ARVO）和國際眼科研究大會（ISER）收錄。同時積極開展了與英國牛津大學(xué)、德國明斯特大學(xué)、瑞士巴塞爾大學(xué)、俄羅斯莫斯科大學(xué)、加拿大曼尼托巴大學(xué)等國際知名院校的合作研究，在國內(nèi)外提升了科研團(tuán)隊的知名度。出色地完成了吉林大學(xué)臨床醫(yī)學(xué)七年制、五年制眼科學(xué)及留學(xué)生全英教學(xué)任務(wù)；2006年以來，共培養(yǎng)博士后2人、博士研究生55人、碩士研究生140人、各類進(jìn)修生和繼續(xù)教育學(xué)員1600余人次。1995年至今，已連續(xù)舉辦了16屆新技術(shù)新療法學(xué)術(shù)研討會，曾邀請全國知名專家黎曉新、趙堪興、葛堅、姚克、王寧利、楊培增、范先群、劉祖國、王文吉、崔浩、馬志中、吳德正、孫旭光、肖利華、王光璐、文峰等來院講學(xué)，或進(jìn)行手術(shù)表演，對于新技術(shù)、新療法的開展和在省內(nèi)外的推廣應(yīng)用起到了巨大的推動作用。2000年以來，每年均承辦吉林省眼科學(xué)術(shù)年會和國家級眼底病繼續(xù)教育學(xué)習(xí)班。2009年成功舉辦“東北亞第七屆眼科學(xué)術(shù)會議”，2010年成功舉辦“中華眼科雜志編委會定稿會”和“第十屆全國眼整形美容手術(shù)進(jìn)展學(xué)習(xí)班”。