合肥市婦幼保健所前身是1953年建立的市兒童健康指導(dǎo)所，同年9月經(jīng)安徽省衛(wèi)生廳批準(zhǔn)，易名為合肥市兒童保健所。1954年4月1日合肥市兒童保健所正式對外開展工作。文化大革命期間，由于極左路線的影響，合肥市兒童保健所于1969年11月19日被撤銷，人員分散。1975年4月經(jīng)合肥市革委會批準(zhǔn)，成立合肥市婦幼保健所，隸屬市衛(wèi)生局領(lǐng)導(dǎo)，定編10人，1976年合肥市婦幼保健所正式運行。1985年經(jīng)合肥市編委正式定編為59人。為了適應(yīng)合肥市城市建設(shè)需要和群眾的婦幼保健需求，經(jīng)合肥市衛(wèi)生局批準(zhǔn)，2001年成立了合肥市婦幼保健所高新開發(fā)區(qū)分所，2002年成立了合肥市婦幼保健所新站試驗區(qū)分所。2006年12月25日,合肥市婦幼保健所從原六安路68號遷往新址--合肥市婦幼保健中心 (益民街15號)辦公。     遷址后的市婦幼保健所保留原有建制和管理關(guān)系,堅持以群體保健工作為基礎(chǔ)，面向基層、預(yù)防為主，為婦女兒童提供健康教育、預(yù)防保健等公共衛(wèi)生服務(wù)，包括完成各級政府和衛(wèi)生行政部門下達的指令性任務(wù)；掌握本轄區(qū)婦女兒童健康狀況及影響因素，協(xié)助衛(wèi)生行政部門制定本轄區(qū)婦幼衛(wèi)生工作的相關(guān)政策、技術(shù)規(guī)范及各項規(guī)章制度；受衛(wèi)生行政部門委托對本轄區(qū)各級各類醫(yī)療保健機構(gòu)開展的婦幼衛(wèi)生服務(wù)進行檢查、考核與評價；負(fù)責(zé)指導(dǎo)和開展本轄區(qū)的婦幼保健健康教育與健康促進工作；組織實施本轄區(qū)母嬰保健技術(shù)培訓(xùn)，對基層醫(yī)療保健機構(gòu)開展業(yè)務(wù)指導(dǎo)，并提供技術(shù)支持；負(fù)責(zé)本轄區(qū)孕產(chǎn)婦死亡、嬰兒及5歲以下兒童死亡、出生缺陷監(jiān)測、婦幼衛(wèi)生服務(wù)及技術(shù)管理等信息的收集、統(tǒng)計、分析、質(zhì)量控制和匯總上報；受衛(wèi)生行政部門委托對托幼園所衛(wèi)生保健進行管理和業(yè)務(wù)指導(dǎo)；開展婦女保健服務(wù)和兒童保健服務(wù)等。在履行公共衛(wèi)生職責(zé)的同時，開展與婦女兒童健康密切相關(guān)的基本醫(yī)療服務(wù)。

    經(jīng)過幾代人不懈的努力，合肥市婦幼保健所及合肥市的婦幼保健事業(yè)都有了很大的發(fā)展。目前，合肥市婦幼保健所現(xiàn)有辦公業(yè)務(wù)用房3500平方米，另在高新開發(fā)區(qū)和新站實驗區(qū)租有420平方米的業(yè)務(wù)用房。設(shè)有辦公室（含醫(yī)教、宣教、信息）、組人科、宣傳科、財務(wù)科、門診部、婦女保健科、兒童保健科、高新區(qū)分所、新站區(qū)分所等科室部門。截止2015年底，職工總數(shù)82人，在編職工48人，各類專業(yè)技術(shù)人員65人，其中高級職稱6人，中級職稱21人,初級職稱31人。擁有原子吸收光譜儀、時間分辨熒光免疫分析儀、血液分析儀、生化分析儀、B超、微量元素分析儀、多標(biāo)計免疫分析系統(tǒng)等萬元以上設(shè)備76（臺、套）。